BIONANO SAPHYR 基因組成像系統(tǒng)助力的結(jié)構(gòu)變異檢測
Saphyr 全基因組成像構(gòu)筑您的新發(fā)現(xiàn)
由 Bionano Genomics 生產(chǎn)的 Saphyr 系統(tǒng)是一款全基因組成像工具，適用于高速、高通量結(jié)構(gòu)變異檢測和分析，具有非同一般的靈敏度和特異度。
應(yīng)用范圍廣泛
借助 SAPHYR 系統(tǒng)，您可以檢測出其他技術(shù)漏診的結(jié)構(gòu)變異
SAPHYR 能夠輕松、高效地以較高特異度和靈敏度檢測結(jié)構(gòu)變異
Saphyr 系統(tǒng)可對在特定序列基序上標(biāo)記的超長、線性化 DNA分子進(jìn)行成像。對整個(gè)基因組上較長毗連讀長的標(biāo)記圖形進(jìn)行對比分析，可顯現(xiàn)結(jié)構(gòu)變異 (>500 bp)，其靈敏度高達(dá) 99%，而假陽性低于 2%。即使等位基因比例低至 5%，也可檢測出所有主要類型的大結(jié)構(gòu)變異。
優(yōu)化的樣本制備和標(biāo)記試劑盒精簡您的工作流程
Bionano Prep Kits 提供了為 Saphyr全基因組成像系統(tǒng)提取和標(biāo)記超高分子量(UHMW) DNA 所必需的關(guān)鍵試劑。
| 新鮮/冷凍血液 | 細(xì)胞培養(yǎng) | 組織 | 植物 |
| Bionano 膠塊提取試劑盒 | √ | √ | √ | √
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| Bionano SP 液相提取試劑盒 | √ | √ |
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| 樣本起始量 | 400 – 650 ul | 1 – 1.5 x 10^6 個(gè)細(xì)胞 | 10 – 30 mg | 2g 幼嫩葉片 |
體驗(yàn) Saphyr Chips 強(qiáng)大功能
Bionano Saphyr 芯片利用成千上萬條平行的納米通道對已標(biāo)記的 HMW DNA 分子進(jìn)行線性化，Saphyr 平臺可直接捕捉 DNA 單分子圖像。
Saphyr 芯片的納米通道技術(shù)可保持 DNA 完整
Saphyr 芯片將 DNA 分子線性化，并通過控制納米通道直徑控制單獨(dú)的一條DNA 雙鏈分子通過一條納米通道，防止其自身折疊或不能充分延展。成熟的納米微流控環(huán)境，使得成千上萬個(gè) DNA 分子同時(shí)迅速通過平行的納米通道，實(shí)現(xiàn)高通量圖像捕捉，并準(zhǔn)確構(gòu)建 Bionano 基因組圖譜。
“ 我們需要類似于 Bionano 提供的結(jié)構(gòu)變異研究數(shù)據(jù)，終幫助患者。它可能會改變診斷疾病的方法，并終改變我們診治疾病的方法?！?/p>
——Rashmi Kanagal-Shamanna 博士
University of Texas, M.D. Anderson Cancer Center
（M.D. 德克薩斯大學(xué)安德森腫瘤中心）
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智能數(shù)據(jù)解決方案
可隨時(shí)管理和監(jiān)測 Saphyr 上的數(shù)據(jù)生成，并可同步生成基因組組裝和結(jié)構(gòu)變異報(bào)告。
BIONANO ACCESS
Bionano Access 是一款適用于 Saphyr 應(yīng)用的基于網(wǎng)絡(luò)的工作中心，它為實(shí)驗(yàn)管理和 Bionano 應(yīng)用提供所有軟件，包括變異注釋和報(bào)告。通過 Bionano Access，您可以：
遠(yuǎn)程設(shè)置和監(jiān)控運(yùn)行，以標(biāo)記可能的樣本質(zhì)量問題
一鍵式結(jié)構(gòu)變異識別和注釋
篩選和生成變異報(bào)告
通過比較多個(gè)樣本實(shí)現(xiàn)的從頭和體細(xì)胞變異檢測，并以dbVar 兼容的 VCF 文件格式導(dǎo)出
生成 de novo 組裝，供種群特定的參考基因組使用
分析流程
Bionano Access 具有多種分析流程，以從您的Bionano 數(shù)據(jù)中獲得多信息。
低頻結(jié)構(gòu)變異流程具有 >90% 的靈敏度，能夠在變異等位基因比例低至 5% 的情況下，*不偏倚地檢測出基因組范圍內(nèi)的 SV，以實(shí)現(xiàn)異質(zhì)性腫瘤/鑲嵌體樣本的分析
拷貝數(shù)變異流程在變異等位基因比例低至 10% 的情況下以較高靈敏度檢測出從 250 kbp 到非整倍體的拷貝數(shù)變化
結(jié)構(gòu)變異注釋流程根據(jù)內(nèi)置對照數(shù)據(jù)庫和外部數(shù)據(jù)庫的變異頻率篩選所有 SV 識別。它通過提供重疊基因信息注釋識別，并執(zhí)行家系分析以及腫瘤與正常情況的對比
De novo 組裝流程為基因組組裝項(xiàng)目構(gòu)建共識圖譜，將序列重疊群連接為染色體臂長組裝，或以*的靈敏度和精度識別雜合結(jié)構(gòu)變異
計(jì)算機(jī)模擬靶標(biāo)分析專為特定的轉(zhuǎn)化和臨床研究量身定制
計(jì)算解決方案
簡化了分析方式
Bionano Compute On Demａnd 是一項(xiàng)按用戶支付的解決方案，可通過 Bionano Access 網(wǎng)絡(luò)應(yīng)用程序訪問，適于 Bionano Solve 操作。Bionano Compute on Demａnd 簡化了分析方式，無需任何傳統(tǒng)的基礎(chǔ)設(shè)施，具有高靈活性和可擴(kuò)展性，值得您實(shí)驗(yàn)擁有。
優(yōu)勢包括：
同時(shí)分析大基因組和大量樣本
執(zhí)行流程分析操作，無需擔(dān)心服務(wù)器容量
數(shù)據(jù)加密，操作安全
數(shù)據(jù)中心符合 IPAA、CSA、SOC2、ITAR 法規(guī)要求
基因組數(shù)據(jù)*終用戶訪問，并于處理后刪除
BIONANO 計(jì)算服務(wù)器
Saphyr 和 Bionano 計(jì)算服務(wù)器以經(jīng)濟(jì)實(shí)惠的緊湊型解決方案提供集群性能。
Bionano 客戶解決方案
Bionano 客戶解決方案團(tuán)隊(duì)致力于解決您應(yīng)用所需，并助您不斷取得成功。
Bionano Genomics 訂購指南
類別
| 部件號 | 產(chǎn)品 |
| 80030 | Bionano Prep SP Blood and Cell DNA Isolation Kit (10 Reactions) |
| 80005 | Bionano Prep DLS Labeling Kit (10 Reactions) |
| 80004 | Bionano Prep Blood and Cell Culture DNA Kit (10 Preps) |
| 80003 | Bionano Prep Plant Tissue DNA Isolation Kit (5 Reactions) |
| 80002 | Bionano Prep Animal Tissue DNA Isolation Kit (10 Reactions) |
| 90040 | 210 Genome Bundle: Saphyr Chip G2.3 (formerly 3x1300*) |
| 90020 | 200 Genome Bundle: Saphyr Chip G1.2 (formerly 2x320*) |
芯片
| 20366 | Saphyr Chip G2.3 (formerly 3x1300*) |
| 20367 | Saphyr Chip G2.2 (formerly 2x1300*) |
| 20319 | Saphyr Chip G1.2 (formerly 2x320) |
儀器
| 90067 | Saphyr System with Bionano Access Server, 1 color |
| 90023 | SaphyrSystem with Bionano Access Server, 2 color |
計(jì)算
| 80013 | Saphyr Compute Server |
| 80014 | Bionano Compute Server |
| 90047 | Bionano Compute On Demand, US |
| 90052 | Bionano Compute On Demand, Germany |
| 90060 | Bionano Compute On Demand, Europe |
| 服務(wù) | 90045 | Saphyr Instrument Extended Warranty Service Contract (1 year) |
| 維護(hù) | 90046 | Saphyr Instrument PM Kit* |
| 90019 | Saphyr Instrument PM Kit |
*僅與 Saphyr 系統(tǒng) #90023 和 #90067（Saphyr 儀器 #60325 和 #60396）兼容
